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提速近10倍 ！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日 ，中国农业科学院作物科学研究所 、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据 的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中 的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上 。

　　全基因组选择作为新一代育种技术 ，通过构建预测模型 ，根据基因组估计育种值进行早期个体 的预测和选择，从而缩短育种世代间隔 ，加快育种进程，节约成本 ，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择 的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率 。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系 。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应 的能力 ，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机 ，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米 、小麦和番茄3种作物 的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度 ；预测精度稳健，在小型数据集上 的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近 ，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好 。

　　该研究得到了国家重点研发计划 、国家自然科学基金 、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目 的支持 。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

农业农村部 ：2022年生猪出栏6.99亿头 供应有保证******

　　中新网1月18日电 国务院新闻办公室18日举行新闻发布会，农业农村部总农艺师、发展规划司司长曾衍德在会上介绍，生猪 是重要的农产品，也是重要的民生产品。中国人 的饮食习惯，猪肉 是餐桌必需的，也可以说是反映小康水平的重要因素 。从去年 的情况看 ，我可以欣慰地告诉大家 ，去年生猪出栏6.99亿头 ，平均两人一头猪 ，我们的生猪供应有保证。

　　曾衍德表示，当时正值备年货 的重要时段，从常年情况看 ，这个时候生猪应该处于价格高的时段，但今年 的情况有点特殊，与往年有所不同 ，生猪供应呈现了三个新 的特点 ：一是出栏增多 。据农业农村部总监测 ，12月份生猪出栏量环比增长18.3%，同比增长7.3% 。二 是消费偏弱 。受新冠疫情影响，餐饮和集团消费尚未完全恢复，猪肉消费出现“旺季不旺” 的现象 。三 是价格下降。今年1月第2周 ，全国生猪均价16.3元/公斤，连续11周回落，已低于16.7元 的养殖成本，部分养殖场出现了亏损 。

　　曾衍德强调，对于今后一个时期生猪行情走势，价格波动是必然 的 ，我们 的目标 是要波动频次降低，幅度降低 。从趋势看 ，关键 是看三个因素 ：一 是能繁母猪存栏量 。12月末全国能繁母猪存栏量接近4400万头 ，为正常保有量4100万头的107% ，就 是说比正常保有量多了一点 ，略高于产能调控绿色合理区域 的上限。二 是中大猪存栏量。11月份和12月份，全国规模猪场5月龄中大猪存栏量同比分别增长10.9%和5.6% ，这些猪大约在春节前后陆续出栏 。三是新生仔猪数量。前期新生仔猪数量增加较多，这些猪大约6个月左右就要出栏 ，后期上市将增加。综合判断，春节前后 ，生猪出栏不会比去年同期少，加上节后猪肉消费进入淡季，猪价走低的趋势明显 ，生猪养殖可能进入阶段性亏损。(中新财经)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）